A Secretaria Municipal de Cultura e Turismo (SECULT) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as políticas públicas voltadas para o desenvolvimento e fomento da cultura e do turismo no município. Compete à SECULT preservar o patrimônio histórico e cultural, promover eventos, apoiar iniciativas artísticas locais e incentivar o potencial turístico de Paraguaçu, visando ao desenvolvimento econômico, à valorização da identidade local e ao bem-estar da população.

A Secretaria Municipal de Desenvolvimento Econômico, Empreendedorismo e Agronegócio (SEDEEA) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as ações setoriais relativas ao fomento do empreendedorismo, ao desenvolvimento econômico e às atividades produtivas rurais. Compete à secretaria promover o bem-estar da população, incentivar a geração de emprego e renda, garantir o bom aproveitamento dos recursos naturais renováveis e coordenar a política municipal de abastecimento alimentar e apoio ao agronegócio.

A Secretaria Municipal de Desenvolvimento Urbano e Rural (SEDUR) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as ações relativas à política de desenvolvimento da infraestrutura urbana e rural, limpeza e obras públicas. Compete à secretaria atuar na regulação e no controle espacial destes setores, visando a um ordenamento justo, ecologicamente equilibrado, ao pleno cumprimento da função social da propriedade e à melhoria da qualidade de vida da população.

A Secretaria Municipal de Educação de Paraguaçu (SEMEP) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as ações relativas à garantia do direito à educação infantil e básica, servindo como suporte aos demais níveis e à educação profissionalizante. Compete à SEMEP atender aos princípios educacionais constitucionais, às determinações da Lei de Diretrizes e Bases da Educação e ao Plano Nacional de Educação (PNE) e suas metas, com vistas ao pleno desenvolvimento da autonomia da pessoa humana, ao seu preparo para o exercício da cidadania, para o trabalho e para o convívio com a coletividade.

A Secretaria Municipal de Esporte e Lazer (SEMEL) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as políticas públicas de fomento ao esporte e ao lazer no município. Compete à SEMEL promover a prática esportiva em diversas modalidades, apoiar atletas locais, organizar competições e eventos recreativos, e administrar os espaços esportivos municipais, visando à inclusão social, à promoção da saúde e à melhoria da qualidade de vida dos cidadãos.

A Secretaria Municipal de Governo e Finanças (SEGOV) tem por finalidade assistir ao Prefeito Municipal no desempenho de suas atribuições constitucionais, na coordenação política, no planejamento financeiro e nas relações institucionais com a sociedade civil e outros entes governamentais. Compete à SEGOV coordenar as atividades, projetos e ações estratégicas da administração municipal, bem como gerir as finanças públicas, a arrecadação, o orçamento e a execução financeira, garantindo o equilíbrio fiscal, a responsabilidade e a transparência na aplicação dos recursos públicos.

A Secretaria Municipal de Habitação e Desenvolvimento Social (SEHAD) tem a finalidade de planejar, promover, elaborar, executar, controlar e avaliar as políticas e programas relativos às áreas de habitação de interesse social e de Assistência Social no município. Compete à SEHAD formular, implementar, monitorar e avaliar estratégias para o Sistema Único de Assistência Social (SUAS), considerando suas funções de proteção, defesa e vigilância social. Atua também estabelecendo diretrizes para a rede socioassistencial, gerenciando programas de transferência de renda, fomentando o controle social, promovendo a educação permanente dos trabalhadores do SUAS e gerindo os respectivos fundos municipais para assegurar sua plena utilização.

A Secretaria Municipal de Meio Ambiente e Desenvolvimento Sustentável (SEMADS) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as políticas públicas de proteção, conservação e recuperação do meio ambiente. Compete à SEMADS promover a educação ambiental, fiscalizar atividades potencialmente poluidoras, gerenciar os recursos hídricos e resíduos sólidos, e implementar ações que garantam o desenvolvimento sustentável do município, assegurando um ambiente ecologicamente equilibrado para as presentes e futuras gerações.

A Secretaria Municipal de Planejamento e Gestão (SEPLAG) tem por finalidade formular, coordenar, executar e avaliar políticas públicas para o desenvolvimento institucional e administrativo do Município. Compete à SEPLAG administrar os processos licitatórios; promover e executar a administração logística de contratos, convênios de aquisições, serviços gerais e transportes; gerir o Patrimônio Público e preservar a memória administrativa do Município; além de propor e executar a gestão de recursos humanos e da saúde ocupacional dos servidores municipais, promovendo a contínua modernização da administração pública.

A Secretaria Municipal de Saúde (SMS) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar, elaborar e avaliar as políticas e programas relativos à área de Saúde Pública em Paraguaçu. Compete à SMS gerir o Fundo Municipal de Saúde, podendo articular-se com órgãos e entidades federais, estaduais e de outros municípios com vistas à melhor realização dos objetivos do Sistema Único de Saúde (SUS), garantindo o acesso universal, igualitário e contínuo às ações e serviços de promoção, proteção e recuperação da saúde da população.

A Secretaria Municipal de Tecnologia da Informação e Inovação (SETINF) tem por finalidade planejar, organizar, dirigir, coordenar, executar, controlar e avaliar as ações e políticas de tecnologia, inovação e modernização digital da Prefeitura. Compete à SETINF gerir a infraestrutura de redes, sistemas e bancos de dados do município, garantir a segurança da informação, desenvolver soluções tecnológicas que otimizem os processos internos e promover a inclusão digital, visando a um atendimento mais ágil, transparente e eficiente ao cidadão.